Причината за болестта на Kawasaki не е напълно изяснена, но едно дете може да е по-вероятно да я развие, ако наследи определени гени от родителите си.
Инфекция
Симптомите на болестта на Kawasaki са подобни на тези при инфекция, така че бактериите или вирусът може да са отговорни. Но досега бактериална или вирусна причина не е установена.
Тъй като болестта на Kawasaki не е заразна, тя не може да се предава от един човек на друг. Това прави малко вероятно причината да е само от вирус.
Болестта на Kawasaki може да засегне деца на всяка възраст. Може да бъде по-сериозно при деца на възраст под 1 година.
Генетика
Децата, които развиват болестта на Kawasaki, могат да бъдат генетично предразположени към нея.
Това означава, че гените, които наследяват от родителите си, могат да ги направят по-склонни да получат заболяването.
Една от теориите е, че вместо да има един-единствен ген, отговорен за болестта на Кавасаки, това може да е резултат от много гени, които всеки леко увеличава шансовете детето да развие заболяването.
Болестта на Кавасаки е по-често при деца от североизточна Азия, особено от Япония и Корея.
Това също предполага, че може да има генетична причина.